Biofisica Teorica, Corso 2014-15
	Orario e aula: GI 10-12 & VE 12:30-14 Aula Careri
	Inizio/fine: 2 Ottobre/19 Dicembre 2014
	Ricevimento: previo appuntamento (email)
	Esame: orale sul programma svolto (prenotazione via Infostud)

	Data		Argomento		Rif.
	2/10		Photoreception		Bialek, Cap 2
	3/10		Photoreception		Bialek, Cap 2
	9/10		Photoreception		Bialek, Cap 2
	10/10		Photoreception		Bialek, Cap 2; [3]
	16/10		Photoreception		Bialek, Cap 2
	17/10		Chemotaxis (intro)		Bialek, Cap 4
	23/10		Diffusion		[1][5]
	24/10		Diffusion		[1][5]
	30/10		Diffusion (FDT)		[1][5]
	31/10		Diffusion (FDT)		[2]
	6/11		(sosp.)
	7/11		Chemotaxis		[1]; Bialek, cap. 4
	13/11		Polymers		[6]
	14/11		Polymers		...
	20/11		Polymers (REM)		[7]
	21/11		Polymers		[8]
	27/11		Polymers (TF-DNA int.)		[8]
	28/11		Two-state systems		Bialek, Cap 4
	4/12		(sosp.)
	5/12		Two-state systems
	11/12		Two-state systems		[4]
	12/12		Optimal information flow		Bialek, Cap 6
	18/12		Optimal information flow		Bialek, Cap 6
	19/12		Optimal information flow		Bialek, Cap 6

	Riferimenti consigliati
	Una buona parte del corso si basa su Biophysics: Searching for Principles di W. Bialek (anche qui). Tuttavia per alcuni argomenti utilizzeremo altre fonti, ad esempio
	[1] H. Berg, Random walks in biology (Princeton UP, 1993) [2] D. Chandler, Introduction to modern statistical mechanics (Oxford UP, 1987) [3] D. Beard and H. Qian, Chemical biophysics (Cambridge UP, 2008) [4] P. Nelson, Biological physics (Freeman & Co., 2004) [5] H. Berg and E.M. Purcell, Physics of chemoreception (pdf) [6] P.-G. de Gennes, Scaling concepts in polymer physics (Cornell UP, 1979) [7] B. Derrida, Random-energy model: An exactly solvable model of disordered systems (pdf) [8] U. Gerland, J. D. Moroz and T. Hwa, Physical constraints and functional characteristics of transcription factor–DNA interaction (pdf)